巨野县人民医院
巨野县人民医院始建于1949年，经过一代又一代人的艰苦努力和顽强拼搏，现已发展成为融医疗、教学、科研、康复、保健、急诊急救服务为一体的综合性三级乙等医院和爱婴医院。医院现有职工1404，卫生技术人员1163人，其中高级专业技术人员107人、中级人员449人；开放床位850张；总资产4.3亿元；设有36个临床科室、7个医技科室、27个职能科室；2018年门急诊就诊量414261人次，出院病人34887人次，住院手术1万余例。拥有德国西门子64排螺旋CT、美国GE16排螺旋CT，德国西门子直线加速器，美国GE
郓城县人民医院
郓城县人民医院是一所集医疗、教学、科研为一体的现代化综合性医院。于1994年、1995年先后被省卫生厅评审为二级甲等医院和爱婴医院。
菏泽市第二人民医院
菏泽市第二人民医院（菏泽市创伤医院）是一所大型综合性医院，是经政府批准的全市唯一警医共建的市创伤医院，同时还是菏泽医专教学医院、菏泽市城镇职工基本医疗保险定点医院、菏泽市工伤保险协议单位,是经省政府批准的菏泽市法医鉴定唯一复核医院，菏泽市新型农村合作医疗定点医院、菏泽市城市医疗救助定点医院。多次获得“山东省卫生系统先进单位”、“菏泽市双文明单位”、“菏泽市行业作风建设先进单位”等荣誉称号。
鄄城县第二人民医院
鄄城县第二人民医院位于鄄二路南段东，南临青年路，交通方便，环境优美，拥有三层门诊楼和四层病房楼各一座，设有32个临床和医技科室，开放病床120张。
山东省菏泽市牡丹区中医医院
菏泽市牡丹区中医医院是牡丹区唯一一家集医疗、科研、教学、预防保健、社区服务为一体，既体现传统中医特色，又具备一定综合服务能力的公立二级甲等中医医院。医院现占地面积1.8万平方米，总建筑面积1.4万平方米。现有职工516人，其中高级职称30人，研究生18人，菏泽市名中医2人，菏泽市优秀中医药人才1人，山东省基层名中医2人。
菏泽医学专科学校附属医院
菏泽医专附属医院是经山东省卫健委批准成立的一所公办非营利性三级综合医院，是菏泽市职工和城乡居民医保定点医院。集医疗、养老、康复、教学、科研和培训为一体的社会公益性的综合性医疗机构，坐落于菏泽市广州路与珠江路交汇处，占地302亩，总投资8亿余元，建筑面积12.8万平方米，设医疗、养老2个区域。其中养老区设置床位1500张，一期开放500张，包括自理区、半失能区、失能区及安宁疗护病房，医护人员24小时值班，棋牌室、水疗中心、图书阅览室、多种健身、娱乐中心、幸福农场等配套设施齐全，专业营养师按老人需求个性化配餐
单县人民医院
单县人民医院(西关医院)为国家级二级综合医院，是全县新农合定点医院，亦是该县城区所有医疗机构中唯一县级医院诊治水平，享受乡(镇)级报销标准的医院，全县参合农民，持合作医疗证、身份证或户口本即可直接来该院住院治疗，不需转诊等手续，并直接享受住院费用(50元以上)报销50%的优厚待遇。出院时当场兑现。该院现有职工200余人，高中级专业技术人员近100人，医院内设有内科、儿科、外科、骨科、妇产科、五官科、皮肤科、中医科等10余个临床科室以及临检、影像、特检等辅检科室。
单县中心医院
单县中心医院地处鲁、苏、豫、皖四省八县结合部，是一所三级甲等综合性公立医院。该院创建于1944年，始称“冀鲁豫第十一专署医院”，1946年称“冀鲁豫边区第三政民医院”，后改称“平原省湖西专署人民医院”、“山东省菏泽专区第二人民医院”，1958年更名为“山东省单县中心医院”。近年来，医院先后成为“济宁医学院附属湖西医院”、“南京军区总医院技术协作医院”、“施尔明眼科视光屈光中心技术协作单位”。
郓城县中医医院
郓城县中医院始建于1987年，是菏泽市北部最大的县级中医院。目前，已成为郓城县中医及中西医结合的医疗、急救、科研、教学和康复中心，病源辐射全国各地。现医院总建筑面积25000平方米，拥有病床200张，职工340人，专业技术人员298人，其中中高级以上技术人员98人。是国家“二级甲等中医院”、郓城县医疗保险定点医院、山东省医疗救助定点医院、卫生部国际救援中心定点医院，是郓城县公安局法医鉴定中心。医院设有16个行政职能科室，18个临床科室，12个辅检科室，能及时为各类患者提供准确及时的服务
菏泽市中医医院
菏泽市中医医院始建于1975年，是一所集医疗、教学、科研、预防、康复、急救于一体的全民所有制三级甲等综合性中医医院；是山东中医药大学、菏泽医专、曲阜中医药学校、莱阳中医药学校、菏泽卫校的教学医院。现有职工400人，其中高级技术人员52人，中级技术人员120人，开放病床300张,年均门诊量15万人次；医院占地60亩，建筑面积2.5万平方米，固定资产3500万元,设有内、外、妇、儿、针灸、推拿、中风、眼科、口腔、皮肤、医疗美容、痔瘘、碎石、肝病、放射、特检、检验等三十多临床医技科室，现已发展成为全市技术实力较
成武县人民医院
成武县人民医院始建于1949年10月，院区占地53亩，建筑面积6.5万平方米，固定资产5.2亿元；现有职工1043人，其中高级专业技术人员89名，中级281名，市、县专业技术拔尖人才20名，编制病床800张，开放病床1000张。设有37个临床医技科室及重症监护中心，年门急诊量40万人次，年收住院病人3.2万人次，年住院手术病人9500余例。
曹县县立医院
曹县县立医院是一所非营利性、国有公立医疗机构。是集医疗、预防、保健、康复、健康教育为一体的二级综合医院。是北京弘慈医疗集团与曹县人民政府合作举办的医院，是山东省立医院集团菏泽市立医院医联体医院，是泰山医学院大学生社会实践基地、菏泽医学专科学校、菏泽家政学院临床教学医院。